1892年，孙中山以各门功课一百分的优异成绩毕业于香港西医书院。

学成后，孙中山被澳门华人公立的镜湖医院聘为西医科主任。他是这所中医院第一位聘任的西医，每日上午在该医院免费出诊，不收分文。下午在写字楼应诊，周日10时至12时在此接种牛痘。当时镜湖医院没有西，孙中山想出自愿赠医、局赠的办法，由他向镜湖医院借款白银1400两，开办中西局。孙中山赠诊后，由这个局赠西给病人。

就这样，有很多中外人士都被孙中山的妙手诊治好了。他对于解剖手术方面，特别精通，曾经在镜湖医院的一次手术中取出一颗肾结石，大如鸡卵，称重一两七钱。当时，能取出这么大的结石，实属罕见。

第二年，中西局迁到广州，孙中山便通过医术来结交官吏商绅，筹划革命运动。清朝官吏都因为他名气高、学问大，从来没把他作为怀疑对象，直到1895年广州起义失败，事情败露后，他才流亡海外，到檀香山开始职业革命者的生涯。

戊申年（1908年），孙中山在新加坡时，中兴报记者口患疾病。孙中山仅通过观其面色便知其病，马上开出方，一星期之后，该记者大病痊愈。

孙中山当年迂至广州行医，是由于他医术精湛，待人亲切，无论门诊或出诊，诊费一律随意而付，加上他特别擅长外科手术和治疗肺病，在澳门行医不满三月就声名鹊起，招致了葡萄牙医生的嫉妒。澳门法律规定，医生从葡政府取得行医执照后方能在当地行医。孙中山受到葡萄牙医生排斥，所以不能在澳门立足。他后来在自传中也谈及此事。